MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316 plasmid pLP-ZJ101

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021903	CCA	2	6	1152	1157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821547
2	NC_021903	T	7	7	1162	1168	0 %	100 %	0 %	0 %	528821547
3	NC_021903	GTT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821547
4	NC_021903	TAA	2	6	1226	1231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528821547
5	NC_021903	TTC	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821547
6	NC_021903	TTTC	2	8	1249	1256	0 %	75 %	0 %	25 %	528821547
7	NC_021903	TTG	2	6	1272	1277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821547
8	NC_021903	TGAT	2	8	1278	1285	25 %	50 %	25 %	0 %	528821547
9	NC_021903	ATCTTT	2	12	1317	1328	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	528821547
10	NC_021903	TCT	2	6	1412	1417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821547
11	NC_021903	ACC	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821547
12	NC_021903	T	6	6	1551	1556	0 %	100 %	0 %	0 %	528821547
13	NC_021903	AGCA	2	8	1642	1649	50 %	0 %	25 %	25 %	528821548
14	NC_021903	TCTTG	2	10	1652	1661	0 %	60 %	20 %	20 %	528821548
15	NC_021903	T	7	7	1674	1680	0 %	100 %	0 %	0 %	528821548
16	NC_021903	ATT	2	6	1789	1794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821548
17	NC_021903	TCTTT	2	10	1856	1865	0 %	80 %	0 %	20 %	528821548
18	NC_021903	T	7	7	1921	1927	0 %	100 %	0 %	0 %	528821548
19	NC_021903	TAAA	2	8	1944	1951	75 %	25 %	0 %	0 %	528821548
20	NC_021903	TTC	2	6	1960	1965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821548
21	NC_021903	TAG	2	6	2032	2037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821548
22	NC_021903	GTT	2	6	2105	2110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821548
23	NC_021903	ACT	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821548
24	NC_021903	ATT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821548
25	NC_021903	TC	3	6	2271	2276	0 %	50 %	0 %	50 %	528821548
26	NC_021903	T	6	6	2322	2327	0 %	100 %	0 %	0 %	528821548
27	NC_021903	TCA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821548
28	NC_021903	ATT	2	6	2359	2364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821548
29	NC_021903	ATC	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821548
30	NC_021903	CCA	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
31	NC_021903	GAA	2	6	3718	3723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821549
32	NC_021903	GCC	2	6	3763	3768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
33	NC_021903	ATT	2	6	3826	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528821549
34	NC_021903	CTT	2	6	3876	3881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821549
35	NC_021903	GGC	2	6	3909	3914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
36	NC_021903	CTG	3	9	3937	3945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
37	NC_021903	CAC	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
38	NC_021903	GCCA	2	8	4068	4075	25 %	0 %	25 %	50 %	528821549
39	NC_021903	AAAC	2	8	4207	4214	75 %	0 %	0 %	25 %	528821549
40	NC_021903	GTG	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
41	NC_021903	TCAAG	2	10	4359	4368	40 %	20 %	20 %	20 %	528821549
42	NC_021903	GC	3	6	4399	4404	0 %	0 %	50 %	50 %	528821549
43	NC_021903	ACC	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
44	NC_021903	TGA	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
45	NC_021903	TGG	2	6	4424	4429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
46	NC_021903	TGG	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
47	NC_021903	TC	3	6	4494	4499	0 %	50 %	0 %	50 %	528821549
48	NC_021903	CGCTG	2	10	4503	4512	0 %	20 %	40 %	40 %	528821549
49	NC_021903	CT	3	6	4522	4527	0 %	50 %	0 %	50 %	528821549
50	NC_021903	CGG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
51	NC_021903	AAC	2	6	4621	4626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821549
52	NC_021903	CCA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
53	NC_021903	AAATG	2	10	4710	4719	60 %	20 %	20 %	0 %	528821549
54	NC_021903	TGG	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821549
55	NC_021903	ATC	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821549
56	NC_021903	TGA	2	6	4800	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
57	NC_021903	ATG	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
58	NC_021903	GCG	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
59	NC_021903	CGA	3	9	4878	4886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
60	NC_021903	GCC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
61	NC_021903	ATCG	2	8	4954	4961	25 %	25 %	25 %	25 %	528821549
62	NC_021903	GACATC	2	12	4993	5004	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528821549
63	NC_021903	ATG	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
64	NC_021903	GTC	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
65	NC_021903	CGA	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
66	NC_021903	AGC	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
67	NC_021903	CAT	2	6	5313	5318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821549
68	NC_021903	CGC	2	6	5324	5329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
69	NC_021903	ACC	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
70	NC_021903	TGA	2	6	5384	5389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
71	NC_021903	CCGC	2	8	5411	5418	0 %	0 %	25 %	75 %	528821549
72	NC_021903	AGC	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
73	NC_021903	AGC	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821549
74	NC_021903	GC	3	6	5574	5579	0 %	0 %	50 %	50 %	528821549
75	NC_021903	GCT	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
76	NC_021903	CGC	2	6	5700	5705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
77	NC_021903	GAT	2	6	5722	5727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
78	NC_021903	CAC	2	6	5733	5738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
79	NC_021903	GCCG	2	8	5758	5765	0 %	0 %	50 %	50 %	528821549
80	NC_021903	ACC	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
81	NC_021903	GCT	2	6	5835	5840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
82	NC_021903	TGA	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
83	NC_021903	GGC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
84	NC_021903	CAC	2	6	5886	5891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821549
85	NC_021903	ATG	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821549
86	NC_021903	GCC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821549
87	NC_021903	GCATG	2	10	6027	6036	20 %	20 %	40 %	20 %	528821549
88	NC_021903	TGGG	2	8	6068	6075	0 %	25 %	75 %	0 %	528821549
89	NC_021903	CG	3	6	6186	6191	0 %	0 %	50 %	50 %	528821549
90	NC_021903	TGC	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
91	NC_021903	CGG	2	6	6260	6265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821549
92	NC_021903	CAT	2	6	6285	6290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821549
93	NC_021903	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821549
94	NC_021903	TGC	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821549
95	NC_021903	CGCC	2	8	6418	6425	0 %	0 %	25 %	75 %	528821549
96	NC_021903	ATC	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821550
97	NC_021903	CTA	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821550
98	NC_021903	CAT	2	6	6994	6999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821551
99	NC_021903	AAC	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821551
100	NC_021903	AATT	2	8	7051	7058	50 %	50 %	0 %	0 %	528821551
101	NC_021903	AGA	2	6	7237	7242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821551
102	NC_021903	CAGC	2	8	7558	7565	25 %	0 %	25 %	50 %	528821552
103	NC_021903	CTG	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821552
104	NC_021903	GTT	2	6	7700	7705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
105	NC_021903	TTTG	2	8	7726	7733	0 %	75 %	25 %	0 %	528821553
106	NC_021903	CTGA	2	8	7751	7758	25 %	25 %	25 %	25 %	528821553
107	NC_021903	TGC	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
108	NC_021903	TGC	2	6	7834	7839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
109	NC_021903	GTT	2	6	7847	7852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
110	NC_021903	GTC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
111	NC_021903	GTTG	2	8	7870	7877	0 %	50 %	50 %	0 %	528821553
112	NC_021903	TTG	2	6	7880	7885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
113	NC_021903	TGA	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821553
114	NC_021903	GTT	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
115	NC_021903	TTG	2	6	8006	8011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
116	NC_021903	GTTC	2	8	8020	8027	0 %	50 %	25 %	25 %	528821553
117	NC_021903	TGGT	2	8	8035	8042	0 %	50 %	50 %	0 %	528821553
118	NC_021903	TGT	2	6	8188	8193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
119	NC_021903	GTC	2	6	8199	8204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
120	NC_021903	GCT	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821553
121	NC_021903	T	6	6	8435	8440	0 %	100 %	0 %	0 %	528821553
122	NC_021903	CTT	2	6	8549	8554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821553
123	NC_021903	T	6	6	8724	8729	0 %	100 %	0 %	0 %	528821553
124	NC_021903	TGG	2	6	8771	8776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821553
125	NC_021903	GTT	2	6	8791	8796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821553
126	NC_021903	ACC	2	6	8852	8857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821554
127	NC_021903	ATG	2	6	8867	8872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821554
128	NC_021903	TGA	2	6	8910	8915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821554
129	NC_021903	GCA	2	6	8937	8942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821554
130	NC_021903	GC	3	6	8960	8965	0 %	0 %	50 %	50 %	528821554
131	NC_021903	CTT	2	6	8975	8980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821554
132	NC_021903	TCAC	2	8	9048	9055	25 %	25 %	0 %	50 %	528821554
133	NC_021903	TTTG	2	8	9067	9074	0 %	75 %	25 %	0 %	528821554
134	NC_021903	GTC	2	6	9096	9101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821554
135	NC_021903	T	6	6	9102	9107	0 %	100 %	0 %	0 %	528821554
136	NC_021903	GTTC	2	8	9127	9134	0 %	50 %	25 %	25 %	528821554
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144	NC_021903	T	7	7	9680	9686	0 %	100 %	0 %	0 %	528821556
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.